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　　抗体具有与被称为抗原的物质特异性结合的功能，以及与其他的生物体分子或细胞协同，将具有抗原的因子无毒化、去除的功能。所谓抗体的名称，是重视此类与抗原结合的功能的名字，作为物质则可称为“免疫球蛋白”。近年来，伴随着基因工程学、蛋白质工程学和细胞工程学的发展，利用具有抗体功能的医药制品——被称为抗体药物——的开发日渐盛行。与传统药物相比，由于抗体药物针对目标分子特异性的作用，因此预期使得副作用减轻，且获得更高的治疗效果，实际上有助于改善各种病况。一方面，由于抗体药物是向生物体大量施用的，相比与其他的重组蛋白质医药制品的情况下，可认为其纯度对质量产生极大的影响。因此，为了生产高纯度的抗体，利用特异性结合抗体的分子作为配体的吸附材料，一般使用亲和层析等手段。抗体医药制品的开发，基本上是单克隆IgG抗体，利用重组培养细胞技术等进行大量生产，利用对IgG抗体具有亲和性的蛋白质进行纯化。作为对IgG抗体具有亲和性的免疫球蛋白结合性蛋白质，蛋白A是已经公知的。蛋白A是由革兰氏阳性菌金黄色葡萄球菌Staphylococcus aureus)产生的一种细胞壁蛋白质，由信号序列S、5个免疫球蛋白结合性结构域(E结构域、D结构域、A结构域、B结构域、C结构域)以及作为细胞壁结合结构域的XM区域组成(非专利文献1)。在抗体医药制品生产工艺的初期纯化工艺(捕获工艺) 中，蛋白A作为配体固定在水不溶性载体上的亲和层析柱(下文中为蛋白A柱)是通常使用的(非专利文献1、非专利文献2、非专利文献3)。为了改善蛋白A柱的功能，正进行各种技术的开发。配体方面的技术开发也不断进步。最开始利用天然类型的蛋白A作为配体，随之加入了蛋白质工程上的修饰而重组的蛋白A作为配体改善柱的功能的技术变得日渐多见。代表性的重组蛋白A可以列举去除了没有免疫球蛋白结合活性的XM区域的重组蛋白A(rProteinA S印harose (商标)，GE HealthCare日本株式会社生产)。以去除了 XM 区域的重组蛋白A作为配体的柱子，具有比传统产品降低的非特异性吸附的优点，目前在产业上也广泛应用。此外，有发明利用向蛋白A中突变导入1个Cys的重组蛋白A(专利文献1)，以及突变导入了多个Lys的重组蛋白A(专利文献2)作为配体。导入这类突变所获得的蛋白A 在固定化于水不溶性载体方面表现出效果，具有抗体对柱的结合容量和减少固定化配体的泄露的优点。作为加入了修饰的重组蛋白A，将向B结构域中导入了突变的修饰结构域(称为Z结构域)利用于配体的技术是广泛已知的(专利文献3、非专利文献1、非专利文献4)。相对于B结构域，Z结构域是导入了这样的突变的修饰结构域，其中四位Gly被Ala取代。需要说明的是，在Z结构域中同时导入用Val取代B结构域1位的Ala的突变，这是为了基因工程上以简化制备连接多个结构域的编码基因为目的的突变，对结构域的功能不产生影响 (例如，在专利文献4中，有使用突变体的实施例，其中Z结构域1位的Val被Ala取代)。已知Z结构域比B结构域的耐碱性更高，具有通过碱洗涤可反复使用的优点。以 Z结构域为基础，通过将Asn取代为其他的氨基酸，发明出赋予了更加耐碱性的配体(专利文献5、专利文献6)，并还开始了产业应用。Z结构域的另一个特征可例举为，与免疫球蛋白的Fab区域的结合力变弱(非专利文献5)。由于该特征，在将结合了的抗体用酸解离的工艺中，具有易于解离抗体的优点(非专利文献1、专利文献7)。除源自B结构域的Z结构域之外，作为高耐碱性的修饰蛋白A配体，也在不断进行以蛋白A的C结构域为基础的研究(专利文献4)。这类配体以发挥野生型C结构域本来具有的高耐碱性为特征，作为替代Z结构域的新的基础结构域而受到瞩目。然而，我们根据关于C结构域的验证结果，明确了在用酸解离与C结构域结合了的抗体的工艺中，存在抗体难以解离的缺点。在非专利文献2或专利文献4中，C结构域表现出与免疫球蛋白的Fab区域强的结合力，推测该特征可能是难以用酸解离抗体的原因。为了改善这一缺点，使用导入了以Ala取代四位的Gly的突变的C结构域，检验抗体的酸解离特性，虽然观察到了相比野生型C结构域的改善，但仍然是不充分的。根据蛋白质水平上的分子间相互作用解析的结果可知，就导入了用Ala取代四位的Gly的突变的C结构域而言，与免疫球蛋白的Fab区域的结合力降低不充分是其的原因。如上所述，对于蛋白A的免疫球蛋白结合性结构域(E、D、A、B和C结构域)而言， 导入用Ala取代四位的Gly的突变的有效性是已经公知的。实际上，自从1987年该“G29A” 突变公开以来，即使在涉及之后开发的修饰蛋白A的现有技术中，也导入了该“G29A”的突变(专利文献2、专利文献4、专利文献6)。但是，在蛋白A的免疫球蛋白结合性结构域的四位上已知的突变，仅仅是将四位的Gly取代为Ala的“G29A”，尚无对该位置导入Ala以外的氨基酸残基的突变的教导。Q9A 是基于考虑到应该使得立体结构上变化最小，仅次于Gly的侧链小的Ala最适合而导入的突变，迄今为止，尚未考虑过用具有更大侧链的氨基酸进行取代(非专利文献4)。因此，立体结构上的变化变大，可能会破坏原来的功能(与免疫球蛋白的结合能力等)，将四位的 Gly取代为比Ala侧链更大的氨基酸的突变，是否能表现出比Ala取代的突变更优秀的效果是不清楚的。尽管在1987年就公开了将四位的Gly取代为Ala的突变(非专利文献4)， 迄今为止也没有导入用Ala以外的氨基酸取代的突变。现有技术文献专利文献专利文献1 美国专利第6399750号公报专利文献2 特开号公报专利文献3 美国专利第5143844号公报专利文献4 特开号公报

　　专利文献5 欧洲专利第1123389号公报专利文献6 国际公开第W003/080655号公报专利文献7 美国公开第2006/0194950号公报非专利文献非专利文献1 =Hober S.等著，J. Chromatogr :B，2007 年，848 卷。40-47 页非专利文献2 =Low D.等著，J Chromatogr :B，2007 年，848 卷，48-63 页非专利文献3 =Roque A. C. A.等著，J. Chromatogr. A，2007 年，1160 卷，44-55 页非专利文献4 :Nilsson B.等著，Protein Engineering，1987 年，1 卷，107-113 页5 Jansson B. ^FEMS Immunology and Medical Microbiology, 1998 年，20 卷，69-78 页发明_既述发明解决的技术问题本发明要解决的课题是开发这样的的修饰技术，所述技术创造出具有比现有的修饰型蛋白A配体更好的抗体酸解离特性的新型修饰蛋白A配体。此外，还以创造出具有高的耐碱性的新型修饰蛋白A配体作为课题。为了解决课题的手段本发明人为了解决上述课题，分子设计了多个重组的蛋白A变体，利用蛋白质工程的手段和基因工程的手段，从转化体获得了所述变体，通过比较研究所获得的上述变体的性质，完成本发明。换言之，本发明涉及对免疫球蛋白具有亲和性的蛋白质，其具有的氨基酸序列是在源自序列号1-5记载的蛋白A的E、D、A、B或C结构域中的任意结构域的氨基酸序列中， 1个以上的Gly被Ala以外的氨基酸取代的序列，并且，其特征是与具有所述Gly被Ala取代了的氨基酸序列的蛋白质相比，该蛋白质对免疫球蛋白Fab区域的亲和性降低。上述Gly优选是与保存在蛋白A的E、D、A、B或C结构域中的C结构域的四位相对应的Gly。上述与C结构域的四位相对应的Gly优选是E结构域的27位的Gly、D结构域的 32位的Gly、A结构域的四位的Gly、B结构域的四位的Gly，或C结构域的四位的Gly。上述Ala 以外的氨基酸优选是 Val、Leu、lie、Phe、Tyr、Trp、Thr、Asp、Glu、Arg、 His、Lys、Met、Cys、Asn、Gln中的任意的氨基酸。上述Ala以外的氨基酸优选是Leu、lie、Wie、Tyr、Trp、Glu、Arg、Met中的任意的

　　本发明还涉及编码上述蛋白质，或编码上述包含多个结构域的蛋白质的DNA。在上述DNA中，与构成相连接的结构域的碱基序列的序列同源性低于90%是优选的。本发明还涉及含有上述DNA的载体。本发明还涉及将上述载体转化于宿主而获得的转化体。上述宿主优选是革兰氏阳性菌。上述革兰氏阳性菌优选是短芽孢杆菌(Brevibacillus)属细菌。上述短芽孢杆菌属细菌优选是桥石短芽孢杆菌(BrevikiciIlus choshinensis)。本发明还涉及使用上述转化体，或者利用DNA的无细胞蛋白质合成体系，制造上述蛋白质，或上述包含多个结构域的蛋白质的方法。在上述制造方法中，将蛋白质积累在转化体的细胞内和/或周质区域内，和/或将蛋白质分泌到转化体的细胞外是优选的。本发明还涉及亲和分离基质，其特征是将上述蛋白质，或上述包含多个结构域的蛋白质作为亲和配体固定在由水不溶性基体材料形成的担体上。上述亲和分离基质，优选与含有免疫球蛋白的Fc区域的蛋白质结合。上述含有免疫球蛋白的Fc区域的蛋白质优选选自抗体、抗体衍生物、抗体片段和或抗体片段衍生物。上述抗体、抗体衍生物、抗体片段和抗体片段衍生物优选是选自IgG和IgG衍生物。本发明还涉及上述亲和分离基质在含有免疫球蛋白的Fc区域的蛋白质的分离中的应用。发明的效果本发明的蛋白质具有比现有的修饰型蛋白A配体更高的耐碱性，并且具有充分的抗体酸解离特性，涉及创造出新型修饰蛋白A配体。通过采用将以所述蛋白质为构成成分的修饰蛋白A配体固定在载体上而成的亲和分离基质，可以分离纯化抗体样分子，更具体而言，可分离纯化含免疫球蛋白的Fc区域的抗体、抗体衍生物、片段抗体或片段抗体衍生物。蛋白A来源的E、D、A、B或C结构域是相互具有高同源性的氨基酸序列，通过将保存在这类结构域之间的Gly取代为Ala以外的氨基酸，即使在使用E、D、A、B或C结构域的任何结构域的情况下，也都具有所述效果。

　　图1.葡萄球菌属Staphylococcus)的蛋白A的E、D、A、B禾Π C结构域的序列比对表。需要说明的是，_(连字符)表示与C结构域的氨基酸残基相同。图2.涉及本发明的实施例9和比较例1，图中显示了(M^9V、C-G29W, C-野生型和C-G29A对于单克隆IgG-Fab的结合反应曲线，图中显示了各种B-G^X、B-野生型和 B-G29A的在碱处理后残留的IgG结合活性(％ )。图4.涉及本发明的实施例11和比较例1，图中显示了各种(M^9X、C-野生型和C-G29A在碱处理后残留的IgG结合活性(％ )。图5.涉及本发明的实施例12，图中显示了在从5连接型C-G^V的氨基酸序列逆翻译而产生的DNA序列中，相连接的各个结构域的DNA序列比对图。图6.涉及本发明的实施例13和比较例2，图中显示了(幻5连接型062抓和(B) 5 连接型C-野生型表达重组菌的培养上清液的SDS-PAGE的分析结果。图7.涉及本发明的实施例13和比较例2，图中显示了(幻5连接型062抓和(B) 5 连接型C-野生型表达重组菌的琼脂糖凝胶电泳的保持质粒的分析结果。发明的实施方案方式本发明的蛋白质是对免疫球蛋白具有亲和性的蛋白质，其具有的氨基酸序列是在源自序列号1-5记载的蛋白A的E、D、A、B和C结构域中的任何结构域的氨基酸序列中，1 个以上的Gly被Ala以外的氨基酸取代的序列，并且，其特征是与具有所述Gly被Ala取代了的氨基酸序列的蛋白质相比，对免疫球蛋白的Fab区域的亲和性降低。蛋白A是由5个免疫球蛋白结合性结构域相连接的形态构成的蛋白质。在多个微生物中都发现了蛋白A，作为发现了蛋白A的微生物可列举例如葡萄球菌属。序列号1-5记载的蛋白A的E、D、A、B和C结构域是能够与免疫球蛋白的互补决定区(CDR)之外的区域结合的免疫球蛋白结合性蛋白质，各个结构域都可与免疫球蛋白的Fc区域、Fab区域和Fab 中的特别是Fv区域各个区域结合。图1的序列比对表显示，源自蛋白A的E、D、A、B和C 结构域，具有相互高同源性的氨基酸序列，在所有的结构域中都保守了与C结构域的四位 Gly、而且甚至与沈位-39位的氨基酸残基相对应的氨基酸序列。源自结构域的氨基酸序列，是指导入突变前的氨基酸序列，例如可列举蛋白A的 E、D、A、B和C结构域中的任何结构域的野生型氨基酸序列，但不限于野生型。除了将与C 结构域的四位相对应的Gly取代为Ala以外的氨基酸的突变外，即使是通过部分的氨基酸的取代、插入、缺失或化学修饰而变异(改变)的氨基酸序列，只要其编码具有与Fc区域的结合能力的蛋白质，就包含在导入突变前的、源自结构域的氨基酸序列中。例如，在B结构域中导入了称为AlV和G29A的突变的Z结构域，其是源自B结构域的序列，在Z结构域的 29位Ala上导入Gly以外的氨基酸残基所获得的蛋白质，也包含在本发明的蛋白质内。并且，在本发明中，称为“蛋白质”的术语是包含了具有多肽结构的所有分子的术语，片段化的或者通过肽键而连接的多肽链也都包含在称为“蛋白质”的术语中。此外，所谓“结构域”，是蛋白质的高级结构的单位，是指由数十至数百个氨基酸残基序列构成，充分表达出某些物理化学或生物化学功能的蛋白质单位。此外，对于将氨基酸取代的突变的表述，在取代位置的编号之前记载了野生型或非突变型的氨基酸，而在取代位置的编号之后，记载了突变的氨基酸。例如，将四位的Gly 取代为Ala的突变记载为G29A。被Ala以外的氨基酸所取代的Gly的数目没有特别的限制，相比具有取代为Ala 的氨基酸序列的蛋白质，与免疫球蛋白的Fab区域亲和性下降且仍具有对免疫球蛋白亲和性就可以。导入突变前的蛋白质是与蛋白A的E、D、A、B和C结构域中的任何结构域的野生型氨基酸具有优选85%以上，更优选90%以上的序列同源性，并具有与Fc区域的结合能力的蛋白质。

　　作为被Ala以外的氨基酸所取代的Gly，只要是在序列号1_5表示的蛋白A的E、 D、A、B和C结构域中的任何结构域中存在的Gly，就没有特别的限制，例如可列举保存在结构域间的Gly，具体而言，可列举与C结构域的四位对应的Gly。此处的“对应”是指如图 1所示的将蛋白A的E、D、A、B和C结构域进行比对时，位于纵列上相同的位置上。作为与C结构域的四位对应的Gly，可列举E结构域的27位的Gly，D结构域的32 位的Gly，A结构域的四位的GlyJP B结构域的四位的Gly。就这些氨基酸序列中的Gly 的位置而言，是由N末端侧的氨基酸残基的插入、缺失、添加而突变获得的，由保留在所述 Gly残基前后的氨基酸序列，本领域技术人员可以确定本发明的导入突变的氨基酸残基。氨基酸的取代意指消除原来的氨基酸，并在相同的位置追加其他的氨基酸的突变。追加的其他氨基酸不受特别的限制，例如可列举天然的构成蛋白质的氨基酸、不构成蛋白质的氨基酸、非天然氨基酸。其中，从基因工程生产的观点看，可以恰当的使用天然类型的氨基酸。作为因取代而导入的Ala以外的氨基酸不受特别的限制，优选是Val、Leu、lie、 Phe, Tyr、Trp, Thr、Asp、Glu、Arg、His、Lys、Met、Cys, Asn、Gln 中的任何氨基酸。其中，优选是 Val、Leu、Ile、Wie、Tyr、Trp、Thr、Asp、Glu、Arg、His、Met 中的任何氨基酸。作为因取代而导入的Ala以外的氨基酸，在碱性条件下的化学稳定性提高这点来说，优选Leu、lie、 Phe, Tyr, Trp, Glu、Arg、Met中的任何氨基酸，最优选是Wie、Tyr, Trp, Met中的任何氨基酸。如上所述，由将Gly取代为Ala以外的氨基酸的氨基酸序列构成的蛋白质，可列举例如在构成由序列号5所示的蛋白A的C结构域的氨基酸序列中，由将四位的Gly取代为 Ala以外的氨基酸所获得的氨基酸序列构成的蛋白质。在本发明的蛋白质中导入了上述氨基酸取代突变的情况下，相比导入了将Gly取代为Ala的突变的蛋白质，具有提高碱性条件下的化学稳定性的效果。特别是，在构成C结构域的氨基酸序列中导入突变所获得的蛋白质，相比来自其他的E、D、A和B结构域的情况， 在碱性条件下的化学稳定性高。此外，在用亲和柱等层析纯化柱纯化蛋白质药物时，存在出于洗净残留在所述柱中的有机物等的目的而使用碱性溶液的情况，本发明中的“碱性条件下”是指能实现达到该洗净目的的程度的碱性。更具体而言，约0. 05-1. ON的氢氧化钠水溶液是合适的，但不限于此。“化学稳定性”是指蛋白质不发生氨基酸残基的化学变化等化学修饰、和酰胺键的转移或切断等化学变性，而保持蛋白质功能的性质。在本发明中，蛋白质的功能保持是指， 与免疫球蛋白的Fc区域的结合活性(不发生化学变性而保持亲和性的蛋白质的比例)。换言之，“化学稳定性”高的情况下，即使在碱性溶液浸渍处理后，与免疫球蛋白Fc区域的结合活性下降的程度也小。例如，对于同一摩尔浓度的野生型或导入突变后的蛋白质，将这2类蛋白质分别在30°C下在0. 5N氢氧化钠溶液中处理25小时后的与免疫球蛋白的Fc区域的亲和性，与各自处理前的同一摩尔浓度的蛋白质显示的结合活性对比，如果野生型蛋白质残留40%， 导入突变后的蛋白质残留50%，则可认为相比野生型蛋白质，导入突变后的蛋白质在碱性条件下的稳定性高。通过使野生型蛋白质的残留结合活性成为10-40%的碱性溶液的浸渍处理，导入突变后的蛋白质的残留结合活性比同一条件处理的野生型蛋白质的残留结合活性提高5%以上，优选10%以上，更优选15%以上的情况下，可认为是本发明所述的“化学稳定性”提高。需要说明的是，在本说明书中，术语“耐碱性”与“在碱性条件下的化学稳定性”是同义的。导入取代突变而获得的蛋白质，表现出与蛋白A的E、D、A、B和C结构域中的任何结构域的野生型氨基酸序列相比，具有优选85%以上，更优选90%以上的氨基酸的序列同源性。作为上述蛋白质的具体实例，可列举由序列号6-18中记载的氨基酸序列组成的蛋白质。本发明的蛋白质既可以是只由单一结构域组成的蛋白质，也可以是单体蛋白质、 多体蛋白质(多结构域型蛋白质)，其优选是由2个以上，更优选2-10个，更优选2-5个单个结构域连接而成的。这些多体蛋白质既可以是为单一的免疫球蛋白结合性结构域的连接体的均二聚体、均三聚体等均多聚体，也可以是为种类不同的免疫球蛋白结合性结构域的连接体的杂二聚体、杂三聚体等杂多聚体。作为根据本发明所获得的单体蛋白质的连接方法，可列举由1个或多个氨基酸残基连接的方法，但不限于这些方法。连接的氨基酸残基数没有特别的限制。优选是不使单体蛋白质的三维立体结构不稳定。本发明的蛋白质，或者包含多个结构域的蛋白质，也可以是作为与公知的对蛋白质表达起辅助作用的或者具有易于纯化的优点的蛋白质的融合蛋白而获得。作为融合蛋白的实例，可列举融合了卵清蛋白、MBP(麦芽糖结合蛋白)或GST(谷胱甘肽S转移酶)的蛋白质，但不限于此。此外，在融合DNA适体(adaptor)等核酸、抗生物素等药物、PEG(聚乙二醇)等高分子的情况下，只要利用了根据本发明获得的蛋白质的有用性，就包含在本发明中。本发明还涉及具有编码通过上述方法获得的蛋白质的碱基序列的DNA。就所述 DNA而言，只要是由翻译构成所述DNA的碱基序列而获得的氨基酸序列构成所述蛋白质就可以。这样的DNA可利用普遍使用的公知方法获得，例如可以利用聚合酶链式反应(下文简称为PCR)法而获得。此外，还可以由公知的化学合成法合成，或者可以由DNA文库获得。 就构成该DNA的碱基序列而言，密码子可进行简并密码子替换，只要在翻译时编码相同的氨基酸，不必需与原来的碱基序列相同。作为在编码本发明蛋白质的DNA中位置特异性的导入突变的方法，可以使用如下的重组DNA技术、PCR方法等。换言之，通过重组DNA技术而导入突变，可以通过盒式突变法进行，例如在编码本发明的蛋白质的基因中，在希望导入突变的目的位点两侧存在合适的限制性酶识别序列的情况下，用上述限制性酶切断这些限制性酶识别序列，去除包含希望导入突变的位点的区域后，插入通过化学合成等仅在目的位点导入了突变的DNA片段。此外，通过PCR导入位置特异性突变可通过双引物法进行，例如通过以编码蛋白质的双链质粒为模板，使用与+和-链互补的含有突变的2种合成寡引物进行PCR。此外，也可以将编码本发明的单体蛋白质(1个结构域)的DNA按预计的数串联连接，从而制备编码多体蛋白质的DNA。例如，就编码多体蛋白质的DNA的连接方法而言，可以是在DNA序列中导入合适的限制性酶切位点，用DNA连接酶将限制性酶片段化了的双链 DNA连接。限制性酶切位点可以是一种，也可以导入多个不同种类的限制性酶切位点。制备编码多体蛋白质的DNA的方法不限于这类连接方法。例如，可以在编码蛋白A 的DNA(例如，国际公开号W006/004067号公报)中应用上述突变导入法来制备。此外，在编码多体蛋白质的DNA中，在编码各个单体蛋白质的碱基序列相同的情况下，由于存在引起宿主的同源重组的可能性，编码相连接的单体蛋白质的DNA的碱基序列间的序列同源性优选低于90 %，更优选低于85 %。就载体而言，包含所编码上述蛋白质或其部分氨基酸序列的碱基序列的DNA，以及能够在可操作连接于所述碱基序列的宿主中发挥功能的启动子。一般而言，可以通过将包含编码上述蛋白质的基因的DNA连接或插入到合适的载体中而获得。用于插入基因的载体只要是可以在宿主中自主复制的，没有特别的限定，质粒DNA或噬菌体(7 7 — 0)DNA都可作为载体使用。例如，在使用大肠杆菌作为宿主的情况下，可列举PQE系列载体OiIAGEN 公司生产)、pET系列载体(Merck公司生产)和pGEX系列载体(GE HealthCare日本株式会社生产)等载体。作为载体，可列举如下在使用短芽孢杆菌属细菌作为转化的宿主的情况下，例如作为枯草杆菌载体的公知的是pUBllO或pHY500 (特开平2-31682号公报)、pNY700 (特开平 4-278091 号公报)、pNU211R2L5(特开平 7-170984 号公报)、pHT210(特开平 6-133782 号公报)，或者，pNCM02 (特开号公报，其为大肠杆菌和短芽孢杆菌属细菌的穿梭载体)等。可以通过向成为宿主的细胞导入本发明的载体，而获得转化体。作为载体向宿主的转化方法，可列举例如使用钙离子的方法、电穿孔方法、原生质体法、醋酸锂方法、农杆菌感染方法、基因枪法，或聚乙二醇法等，但不限于此。此外，作为在宿主中维持载体的方法， 可列举例如通过在细胞内独立于基因组的载体的自主复制来维持的方法，或将制作的基因整合到基因组中，依赖基因组的复制而维持的方法等。对于成为宿主的细胞，并没有特别的限制，在可廉价的大量生产的基础上，优选可恰当的使用大肠杆菌、枯草杆菌、短芽孢杆菌属、葡萄球菌属Staphylococcus)、链球菌属 (Streptococcus)、链霉菌属(Streptomyces)、棒状杆菌属(Corynebacterium)等真细菌。 更优选的可以是枯草杆菌、短芽孢杆菌属、葡萄球菌属、链球菌属、链霉菌属、棒状杆菌属等革兰氏阳性菌。更优选的是公知的适用于大量生产蛋白A的实例(国际公开第W006/004067 号公报)短芽孢杆菌属细菌。作为短芽孢杆菌属细菌，虽无限定，但可示例土壤短芽孢杆菌(Brevikicillus agri)、波茨坦短芽孢杆菌(B. borstelensis)、简短短芽孢杆菌(B. brevis)、中孢短芽孢杆菌(B. centrosporus)、B. choshinensis、美HB短芽抱杆菌(B. formosus)、B. invocatus、 侧孢短芽孢杆菌(B. Iaterosporus)、喜湖短芽孢杆菌(B. Iimnophilus)、副短短芽孢杆菌 (B. parabrevis)、罗伊兹短芽孢杆菌(B. reuszeri)、热红短芽孢杆菌(B. thermoruber)。优选的可示例简短短芽孢杆菌47株(JCM6285)、简短短芽孢杆菌47K株(FERM BP-2308)、 简短短芽孢杆菌47-5Q株(JCM8970)、桥石短芽孢杆菌(B. choshinensis)HPD31株(FERM BP-1087)和桥石短芽孢杆菌(B. choshinensis)HPD31-0K 株(FERM BP-4573)。为了适应提高产量等目的，可以使用上述短芽孢杆菌属细菌的蛋白酶缺陷株、高表达株或芽孢形成能力缺失株等突变株(或诱导株)。具体可列举源自桥石短芽孢杆菌HPD31的蛋白酶突变株桥石短芽孢杆菌HPD31-0K(特开平6496485号公报)，或没有芽孢形成能力的桥石短芽孢杆菌HPD31-SP3(国际公开第W005/045005号公报)。本发明的蛋白质可使用转化体或上述使用了 DNA的无细胞蛋白质合成系统来制备。在使用转化体制备蛋白质的情况下，可以通过将蛋白质积累在转化体的细胞内 (含周质区域内)或培养液(细胞外)中而回收。蓄积在细胞内时，其优点是可以防止表达的蛋白质的酸化，也不与培养基组分发生副反应，蓄积在周质区域内时，优点是可以抑制因细胞内蛋白酶的分解。另一方面，如果将蛋白质分泌在转化体的细胞外，就不需要菌体破碎和提取工艺，优点是降低了生产成本。具体的方法是，在蛋白质蓄积在培养细胞内(含周质区域内)的情况下，可以通过例如从培养液离心分离、过滤等方法收集菌体，然后，通过超声破碎、法式压滤法等将所述菌体破碎，和/或通过添加表面活性剂等使其溶解，回收细胞内蓄积产生的蛋白质。在分泌生产重组蛋白质的情况下，可以在培养结束后，通过离心分离、过滤等普通的分离方法，将培养细胞和含有分泌生产的蛋白质的上清液分离，回收所生产的重组蛋白。在通过无细胞的蛋白质合成体系制备本发明的蛋白质的情况下，作为所述无细胞的蛋白质合成体系，可以是使用细胞提取液在体外合成蛋白质的体系，并无特殊限制，例如，可以使用原核细胞来源的、植物细胞来源的、高等动物细胞来源的合成体系等。本发明的蛋白质可以如下制备在培养基中培养上述转化体，使其以与其他的蛋白质的融合蛋白的形式表达，从所述培养物中提取所述融合蛋白，通过适当的蛋白酶切割所述融合蛋白，提取所需要的蛋白质。在培养基中培养本发明的转化体的方法，根据用于宿主培养的常用方法进行。用于所获得的转化体的培养的培养基并无特殊限制，只要能够高效、高产量的生产所述蛋白质即可。具体而言，可以使用葡萄糖、蔗糖、甘油、多价蛋白胨、肉的提取物、酵母提取物、酪蛋白氨基酸等作为碳源或氮源。此外，必要时相应添加钙盐、钠盐、磷酸盐、镁盐、锰盐、锌盐、铁盐等无机盐类。在使用营养缺陷性的宿主细胞的情况下，可添加生长繁殖必需的营养物。此外，必要时也可以添加青霉素、红霉素、氯霉素、新霉素等抗生素。作为培养以大肠杆菌为宿主而获得的转化体的培养基没有特殊的限定，例如，可列举LB培养基(1%胰蛋白胨，0.5%酵母提取物，NaCl)或2XYT培养基(1.6%胰蛋白胨，1.0%酵母提取物，0.5% NaCl)等。作为培养以短芽孢杆菌属细菌为宿主而获得的转化体的培养基没有特殊的限定，例如，可列举TM培养基(1 %蛋白胨，0. 5 %肉的提取物，0. 2 %酵母提取物，1 %葡萄糖， ρΗ7· 0)或2SL培养基(4%蛋白胨，0.5%酵母提取物，2%葡萄糖，ρΗ7. 2)等。进一步的，为了抑制由存在于菌体内外的宿主来源的蛋白酶所导致的该目标蛋白的分解和低分子化，可以添加适当浓度的各种公知的蛋白酶抑制剂，即，苯甲基磺酰氟 (PMSF)、苯甲脒、4-(2-氨乙基)苯磺酰氟(AEBSF)、抗蛋白酶(AntWain)、糜蛋白酶抑素、亮抑蛋白酶肽、胃酶抑素A、膦酰二肽(Phosphoramidon)、抑肽酶(aprotinin)、乙二胺四乙酸 (EDTA)，和/或其他市售的蛋白酶抑制剂。进一步的，为了使本发明的蛋白质正确的折叠，可以利用例如GroEL/ES、Hsp70/DnaK、HSp90、HSpl04/ClpB等分子伴侣。分子伴侣可以通过共表达或融合蛋白化等手段，与本发明的蛋白质共存。在以蛋白质的正确折叠为目的的情况下，向培养基中添加促进正确折叠的添加剂，或者在低温下培养等手段是可以的，但不限于此。可以在15-42°C的培养温度下，优选20-37°C下，通过在通气搅拌条件下进行数小时-数天的好氧性培养来制备蛋白质。根据情况不同，也可以隔绝通气进行厌氧性培养。可以通过亲和层析、阳离子或阴离子交换层析、凝胶过滤层析等单独或恰当的组合，进行蛋白质的提纯。确认所获得的提纯物质是否是目的蛋白，一般可以进行的方法是例如SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳、N末端氨基酸序列分析、Western印迹等。通过将本发明的蛋白质作为亲和配体固定在由水不溶性的基体材料制成的载体上，可以获得亲和分离基质。在此，“亲和配体”是指以抗原和抗体的结合为代表，基于特异性的分子间亲和性，从某些分子的集合中选择性的捕获(结合)目标分子的物质(官能团) 的术语，在本发明中，指特异性结合免疫球蛋白的蛋白质。在本说明书中，在仅记载“配体” 的情况下，与“亲和配体”也是同义的。在本发明中使用的由水不溶于性基体材料制成的载体可以列举玻璃珠、硅胶等无机载体，交联聚乙烯醇、交联聚丙烯酸、交联聚丙烯酰胺、交联聚乙烯等合成高分子，或由结晶纤维素、交联纤维素、交联琼脂糖、交联右旋糖等多糖形成的有机载体，此外，由这些组合而获得的有机-有机、有机-无机等复合载体等。作为市售商品，可以列举作为多孔纤维素凝胶的GCL2000(生化学工业株式会社生产)、烯丙基右旋糖和亚甲基双丙烯酰胺以共价键交联的kphacryl S-1000 (GE HealthyCare日本株式会社生产)、作为丙烯酸类的载体的Toyopearl (东曹株式会社生产)、作为琼脂糖类的交联载体的kpharose CL4B(GE HealthyCare日本株式会社生产)，或作为纤维素类的交联载体的Celluf ine (千^ 〃株式会社生产)等。但是，本发明中的水不溶性载体不限于这些示例的载体。此外，本发明中使用的水不溶性载体，从所述亲和分离基质的使用目的和方法来看，希望是表面积大的，优选是具有多个合适大小的细孔的多孔物质。载体的形态可以选择任意的形态，珠状、独石状、纤维状、膜状(包括中空类的)等都是可以的。关于配体的固定化方法，可以是例如利用配体中存在的氨基、羧基或巯基，通过传统的偶联方法与载体结合。作为偶联方法，可列举使载体与溴化氰、表氯醇、二缩水甘油醚、 对甲苯磺酰氯(卜* 夕π，4 K )、三氟代乙烷磺酰氯(卜^ * 夕π，4 K )、胼和高碘酸钠等反应而活化载体(或者在载体表面导入反应官能团)，与作为配体而固定化的化合物进行偶联反应的固定化方法，此外，可列举在载体和作为配体而固定化的化合物存在的体系中，添加类似碳二亚胺这类的缩合试剂，或者类似戊二醛这类的在分子中具有多个官能团的试剂，通过缩合、交联来固定化的方法。此外，可以在配体和载体之间导入由多个原子构成的间隔分子，也可以将配体直接固定在载体上。因而，为了固定化，可以对本发明的蛋白质进行化学修饰，也可以加入对固定化有用的氨基酸残基。作为对固定化有用的氨基酸，可列举侧链具有对固定化的化学反应有用的官能团的氨基酸，例如可列举侧链含有氨基的Lys、侧链含有巯基的Cys。本发明的实质是，赋予了本发明中蛋白质的效果，在固定了该蛋白质作为配体的基质中也同样而赋予，不论为固定化而进行何种修饰、变化，也都包含在本发明的范围内。

　　上述亲和分离基质优选是与包含免疫球蛋白的Fc区域的蛋白质结合的。亲和分离基质结合的、包含免疫球蛋白的Fc区域的蛋白质，可列举例如包含免疫球蛋白的Fc区域的抗体、抗体衍生物、片段抗体和片段抗体衍生物。使得通过亲和柱 层析提纯法分离提纯这些蛋白质成为可能。此处“包含免疫球蛋白的Fc区域的抗体”可列举例如IgG。“抗体衍生物”是指IgG 衍生物，可列举例如将人IgG的一部分结构域替换为其他物种的IgG抗体的结构域而融合成的嵌合抗体，或将人IgG的CDR部分替换为其他物种的抗体的CDR部分而融合成的人源化抗体。“片段抗体”可列举例如仅由人IgG的Fc区域构成的蛋白质。“片段抗体衍生物” 可列举例如由人IgG的Fv区域和Fc区域融合而成的人工抗体。此外，这些抗体、抗体衍生物、片段抗体和片段抗体衍生物在说明书中使用“抗体样分子”的表述作为统称。可以使用亲和分离基质分离包含免疫球蛋白的Fc区域的蛋白质。包含Fc区域的蛋白质(上述抗体、抗体衍生物、片段抗体或片段抗体衍生物)的分离，可以使用已经作为商品存在的蛋白A柱按照亲和柱层析提纯法的步骤实现(非专利文献3)。换言之，将含有抗体、抗体衍生物、片段抗体或片段抗体衍生物的缓冲液调整为中性后，使所述溶液通过填充了本发明的亲和分离基质的亲和柱，吸附抗体、抗体衍生物、片段抗体或片段抗体衍生物。然后，使适量的纯缓冲液通过亲和柱，将柱内部洗净。此时，所预期的抗体、抗体衍生物、 片段抗体和片段抗体衍生物被吸附到柱内的本发明的亲和分离基质上。然后，将调整到合适的PH的酸性缓冲液(也有时含有促进从所述基质解离的物质)流经柱子，通过洗脱所预期的抗体、抗体衍生物、片段抗体和片段抗体衍生物，实现高纯度的提纯。就本发明的亲和分离基质而言，通过使缓冲液流经而洗净，可以循环利用，所述缓冲液是完全不损坏配体化合物或载体的基体材料的、合适的强酸性或强碱性的纯缓冲液 (也有含合适的变性剂或有机溶剂的溶液的情况)。一般而言，构成蛋白A的各个结构域，与Fc区域的结合比与Fab区域的结合更强 (非专利文献幻。因此，本发明蛋白质的“对免疫球蛋白的亲和性”实质上是指对Fc区域的亲和性的表述，即使与Fab区域的结合力发生变化，与免疫球蛋白的亲和性的强度也没有很大的变化。就本发明的蛋白质而言，蛋白A的免疫球蛋白结合结构域所具有的、与Fab 区域的次级亲和性降低，产生如下效果，即可以排除与免疫球蛋白的相互作用中的次级结合的影响。一方面，由于保留了与Fc区域的亲和性，因而保留了与全体免疫球蛋白的亲和性。就本发明的蛋白质所具有的与免疫球蛋白的亲和性而言，当通过下文所述的Biacore 系统测定对于人免疫球蛋白G制品的亲和性时，亲和常数优选在IO6(M—1)以上，更优选在 IO7 (M—1)以上。本发明的蛋白质与免疫球蛋白的亲和性可以通过例如使用表面质子共振原理的 Biacore系统(GE HealthCare日本株式会社生产)等生物传感器来测定，但不限于这类测定方法。作为测定条件，可以检测出蛋白A与免疫球蛋白的Fc区域结合时的结合信号就行，可以通过在20-40°C (恒定温度)的温度，PH6-8的中性条件下测定而进行简单的评价。作为本发明的蛋白质表现出亲和性的对象，可列举例如不是不充分地含有Fab区域或Fc区域的免疫球蛋白分子，或者，可列举其衍生物，但不限于此。本发明的蛋白质与含有一部分Fc区域侧的蛋白质也具有亲和性，结合对象不必须是含有完整Fc区域的蛋白质。由于抗体的立体结构都是已知的，在蛋白质工程学上保持了本发明蛋白质结合的区域的立体结构的基础上，还可以对Fab区域或Fc区域进行进一步的改变(片段化)，本发明的蛋白质也能够结合这些衍生物。作为本发明的蛋白质的实例，可列举与IgG的亚型1、2或4的 Fc区域具有亲和性的蛋白质，其特征在于，就与属于VH3亚家族的IgG的Fab区域的亲和性而言，相比导入了将C结构域的四位的Gly替换为Ala的突变后的蛋白质，其亲和性降低。一方面，当测定与免疫球蛋白的Fab区域的亲和性时，对作为结合对象使用的免疫球蛋白分子没有特殊的限制，只要可以检测出与Fab区域的结合即可，但是由于使用含 Fc区域的免疫球蛋白分子时，也检测出与Fc区域的结合，故优选使用诸如去除Fc区域而将免疫球蛋白分子片段化所获得的Fab片段或Fv片段。可以使用属于VH3亚家族的人IgG(单克隆抗体)来确认本发明蛋白质与免疫球蛋白的Fab区域的结合。进一步的，更优选蛋白A与Fab区域的结合已确认、且属于VH3亚家族的免疫球蛋白的Fab片段。人的VH生殖细胞基因约一半属于VH3亚家族，实际上，由属于VH3亚家族的IgG抗体构成的药物正在销售、开发中。进一步地，与属于VH3亚家族的免疫球蛋白的Fab片段的结合能力的残留，会对抗体的酸解离特性产生不良影响，这可以说已经是可通过文献而公知的信息(Ghose S.等，Biotechnology and bioengineering, 2005年，第92卷，第6期)。本领域技术人员可以如下方便的验证亲和性的差异，通过在相同的测定条件下， 获得与相同的免疫球蛋白分子的结合反应曲线，根据分析时所获得的结合参数，与导入了将对应C结构域的四位的Gly替换为Ala的突变的蛋白质进行比较。此时，比较亲和性差异的两者的序列在突变位置(C结构域的情况下是四位)以外的序列必须是相同的，例如在将四位的Gly替换为Ala的B结构域变体为比较对象的情况下，与四位的Gly替换为了 Ala以外的氨基酸的B结构域变体进行比较是恰当的，而与例如四位的Gly替换为了 Ala 以外的氨基酸的C结构域变体进行比较则是不恰当的。结合参数可使用例如亲和常数(KA)或解离常数(KD)(永田等著“生体物質相互作用Θ J 7 夕4 Λ解析実験法，，，ν ^ -J 力‘一· 7工7，一夕東京，1998年，第41 頁)。本发明的各个结构域变体与Fab的亲和常数可以例如通过如下实验体系获得，利用 Biacore系统，在传感芯片中固定属于VH3亚家族的免疫球蛋白的Fab片段，在温度25°C， pH7. 4的条件下流路添加各结构域变体的实验体系。相比四位的Gly替换为Ala的变体， 将四位的Gly替换为Ala以外的氨基酸的变体的亲和常数(KA)优选降低至1/2以下的变体可适合使用，更优选降低至1/5以下，更优选降低至1/10以下的变体可适合使用。特别的是，将四位的Gly替换为Ala的C结构域变体与Fab的KA —般是1 X IO4 1 X IO5 (M—1)， 而将四位的Gly替换为Ala以外氨基酸的C结构域变体且其KA不足1 X IO4 (M—1)的可合适在本发明中使用，更合适的可使用KA为Ο.δΧΙΟ4^1)以下的变体。需要说明的是，在上述KA测定中，可以使用将免疫球蛋白G用木瓜蛋白酶解片段化为Fab片段和Fc片段而获得的Fab，或者可以使用通过基因工程手段获得的、用仅表达免疫球蛋白G的Fab区域的生产系统制造的Fab。就与化学处理后的免疫球蛋白的结合活性而言，可以通过与上述相同的，使用表面质子共振原理的Biacore系统(GE HealthCare日本株式会社生产)等生物传感器来进行试验，但不限于此。但是在化学处理后的结合活性(相比进行化学处理前的结合活性)中，作为结合参数的亲和常数(KA)和解离常数(KD)是不合适的(通过化学处理，1分子蛋白质与免疫球蛋白的结合能没有变化)。在计算化学处理后的蛋白质的残存结合活性的情况下，例如将蛋白质固定在传感芯片上，在对蛋白质化学处理之前和之后，添加了相同浓度的免疫球蛋白时的结合信号大小、或被称为理论的最大结合容量(Rmax)的结合参数是优选使用的，但不限于此。例如，也可以使用固定免疫球蛋白，添加化学处理前后的蛋白质的实验体系。由于亲和分离基质具有与上述免疫球蛋白的Fab区域的结合能降低的性质，在用酸性溶液洗脱抗体的步骤中，其解离抗体的特性是优秀的。具体而言，可以通过更偏中性的酸性洗脱条件进行洗脱，从而获得抑制酸性条件对抗体的破坏的效果。所谓的更偏中性的酸性洗脱条件，具体而言，通常的酸性洗脱条件是PH2. 0-3. 5左右，与此相对比的，更偏中性的酸性洗脱条件是PH3. 0-5.0左右，在此条件下的洗脱对抗体的破坏小((ihose S.等， Biotechnology and bioengineering，2005，第92卷，第6期)。优秀的抗体酸解离特性是指这样的特性，即，在更偏中性的酸性洗脱条件下解离，在酸性条件下洗脱抗体时的洗脱峰形更加尖锐。层析的洗脱峰形变得更尖锐，则可以用更小体积的洗脱液回收含有更高浓度的抗体的洗脱液。此外，可以提供这样的基质，所述基质的用酸性溶液解离抗体的特性优秀，且在碱性条件下的化学稳定性高。具体而言，可以提供这样的基质，所述基质在为了从基质去除杂质(宿主来源的蛋白质、碳水化合物、脂类、细菌、病毒等)再利用而用氢氧化钠水溶液 (0.05M-1M左右)进行洗涤的过程中，对配体分子的破坏更小。需要说明的是，为了再利用的洗涤方法不限于氢氧化钠水溶液的洗涤，能够高效的洗涤、杀菌且更便宜的实施的手段也可适用。实施例基于以下实施例，对本发明进行更详细的说明，但是本发明不限于这些实施例。 对于实施例中获得的各种蛋白质(结构域没有连接的、单一结构域类型的蛋白质)，有时以“表示结构域的字母-导入的突变(野生型的话为野生型)”的形式表述。例如，野生型C结构域表述为“C-野生型”，导入了 G29V突变的C结构域变体表述为“(M^9V”。此外，在本发明中，将对应于C结构域的四位的Gly替换为Ala以外的氨基酸的突变，统称表述为“G29X”，例如涉及在C结构域中导入了本发明突变的各种C结构域变体时，表述为 “C-G29X”。实施例1 制备编码野生型C结构域(C-野生型)的DNA以编码野生型蛋白A的表达载体PNK3262NX为模板，使用序列号19_20的寡核苷酸引物进行PCR，扩增编码C-野生型(序列号5)的DNA片段(177bp)。用作模板的 PNK3262NX，是已经公知的pNK3262的一部分改变了的蛋白A表达载体，其编码去除了细胞壁结合结构域X的一部分等的野生型蛋白A(国际公开号WO 06/004067号公报)。通过本实施例获得的、编码C-野生型的碱基序列在序列号21中显示。此外，序列号19-20中显示的寡核苷酸引物，是如下设计的使用其而扩增了的DNA，在编码C-野生型的基因的外侧具有BamHI和EcoRI的限制性酶识别位点，并且在C-野生型的C末端侧(Lys_58之后)具有 Cys残基。将所获得的DNA片段用限制性酶BamHI和EcoRI (均为Takara公司生产)消化后，纯化回收。将表达GST融合蛋白的载体pGEX-6P-l(GE HealthCare日本株式会社生产) 用BamHI和EcoRI消化后，纯化回收，进一步通过碱性磷酸酶处理而进行脱磷酸化处理。用 DNA连接酶Ligation High (T0Y0B0公司生产)将编码C-野生型的DNA片段和所述表达载体pGEX-6P-l连接，构建GST融合型C-野生型表达质粒。使用通过上述操作获得的包含编码C-野生型的基因的表达质粒，进行大肠杆菌 HBlOl (Takara公司生产)的转化，通过常规方法扩增并提取质粒DNA。实施例2 制备编码野牛型B结构域(B-野牛型)的DNA如图1所示，B-野生型的氨基酸序列(序列号4)是在C-野生型中导入T23N、 V40Q、K42A、E43N、I44L的突变所获得的序列。因此，编码B-野生型的DNA，是在编码C-野生型的DNA (序列号21)中导入T23N、V40Q、K42A、E43N、I44L的突变而制备的。以实施例 1获得的C-野生型表达质粒为模板，使用序列号22-23所示寡核苷酸引物，获得这样的质粒，所述质粒含有编码用QuickChange方法在C-野生型中导入了 T23N突变的氨基酸序列的基因。此外，以所获得的质粒为模板，使用序列号M-25所示寡核苷酸引物，获得这样的 GST融合型B-野生型表达质粒，所述质粒包含以同样的QuickChange方法导入V40Q、K42A、 E43N、I44L的突变的、编码B-野生型的基因。使用该表达质粒，进行大肠杆菌HBlOl (Takara公司生产)的转化，通过常规方法扩增并提取质粒DNA。序列号沈中显示了本实施例获得的编码B-野生型的DNA序列。需要说明的是，QuickChange方法是使用DNA聚合酶Pfu Turbo和甲基化DNA (模板DNA)切割酶DpnI (均为Mratagene公司生产)，根据Mratagene公司的说明书实施的。实施例3 向Gly-四导入突变以实施例1获得的C-野生型表达质粒和实施例2获得的B-野生型表达质粒为模板，使用表1所示序列号27-52的引物，用QuickChange方法获得编码变体的各种基因。以C-野生型表达质粒为模板，将序列号5的氨基酸序列中的Gly-四替换为Val、 Leu、IleATyiNPheAThiN^mkiNAspAGliuArgAHis 或 Met，获得编码序列号 6-18 的任一项记载的C结构域变体(C-G^X)的各种表达质粒。同样的，以B-野生型表达质粒为模板， 将序列号4的氨基酸序列中的Gly-四替换为Val、Arg、Asp或Trp，获得编码序列号53-56 的任一项记载的B结构域变体(B-G^X)的各种表达质粒。使用通过上述方法获得的、包含编码序列号6-18和序列号53-56中任一项的基因的各种上述表达质粒，进行大肠杆菌HBlOl (Takara公司生产)的转化，通过常规方法扩增并提取质粒DNA。关于序列号27-52的引物，表1显示了各种引物分别在导入何种突变时使用。[表1]