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　　STRING是一个经典的蛋白互作网络构建数据库，科研必备。目前版本v11.5，不过包含新基因组、数据源和方法的v12.0即将推出，有兴趣的也可以去测试体验下。在STRING首页SEARCH进入检索页，可在左侧栏目中选择检索方式，如按单个蛋白检索，输入蛋白名和物种，点击SEARCH即可。这里以TP53为例：Continue后可以得到与TP53相关的互作网络。玻璃珠可以任意拖拽，点击图中珠子或对应连线可以查看蛋白详细信息及互作Evidence。回到检索页，左侧选择第二栏Multiple proteins，输入多个目标蛋白继续SEARCH可以探索多个目标蛋白间的互作关系。如下，得到了目标蛋白间的PPI网络。点击网络图下方各个模块，可获得更多维度信息数据。点击Exports可导出网络图表或节点边线. GeneMANIA

　　GeneMANIA是一个可轻松获得优质PPI网络图图的交互化网站。用户给定单个或多个查询基因后，即可生成互作关系网络。目前支持9个物种，数据收集来自GEO、BioGRID、IRefIndex、I2D以及生物体特定的功能基因组学等大型、公开可用生物数据集。操作easy，在左上角栏目中选择对应物种、输入目标基因ID，单基因和多基因查询都支持。这里仍以TP53为例。Search后即可获得互作网络图，如下。将光标放在某个节点上，会着重强调仅与其关联互作的其它节点和连线，点击节点会显示该基因的简介。展开右侧面板可自定义网络图连线来源，如物理互作、共表达、遗传互作、共定位、富集通路、网站预测等，边线颜色和条目一一对应。单击连线，会显示文献支持，点击可跳转对应文献PubMed页。三种网络图布局样式可按个人喜好选择：（样式1—同心二分）（样式2—线的布局若不满意，可以反复点击尝试，每次都会生成新布局样式。（样式3—力导向）此外，点击左下方饼状图标，可按功能注释为网络节点着色。最多可自选7种。多基因查询方法相同。同样支持导入cytoscape绘图，或者直接通过Cytoscape应用程序访问。相关算法或可自行阅读文献。