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　　博淼生物科技（北京）有限公司Yourownlabroratory——您的专属实验室蛋白质结构域预测工具Esignal：信号传导系统蛋白的结构域预测工具，凡是涉及到信号传导系统的蛋白用这个预测效果最佳SignalP：信号肽预测工具，适合定位于非胞质位置的蛋白质Emotif：结构域预测工具，由于其用motif电子学习的方法产生结构域模型，故预测效果比Prosite好Ematrix：是用Matrix的方法创建的结构域数据库，可与emotif互相印证。其速度快，可快速搜索整个基因组InterPro：提供的服务，用图形的形式表示出搜索的结构域结果TRRD：转录因子结构域预测的最好数据库。但不会用Protscale：可分析该序列的各种性状如活动度、亲水性（Kyte&Doolittle）、抗原性（Hopp&Woods）等通过寻找MOTIF和Domain来分析蛋白质的功能A.MOTIF是蛋白中较小的保守序列片断，其概念比Domain小PROSITE：博淼生物科技（北京）有限公司Yourownlabroratory——您的专属实验室是专门搜索蛋白质Motif的数据库，其中signatureseqs是最重要的motif信息B.Domain：若干motif可形成一个Domain，每个Domain形成一个球形结构，Domain与Domain之间通常像串珠一样相连Pfam：可以搜索某段序列中的Domain，并以图形化表示出来。这个数据库非常重要。用法：在搜索栏中输入蛋白的swissprot的序列号CDD：搜索时在每个蛋白质Link旁都有Blink，Domains两个链接。Domains可以直接看到这个蛋白的确定的结构域。如果要在CDD数据库寻找Domain信息，则可进入Blink链接，再进行CDD搜索，就可以了。看Domain的详细信息可以到：上进行搜索查看蛋白跨膜序列分析kyte-Doolittle疏水性分析：每个等于或高于1.8的峰都可能是跨膜结构域蛋白质结构预测工具PREDATOR：蛋白质二级结构预测工具蛋白质糖基化位点的预测这是个综合连接。包括：DictyOGlycpredictionserver，博淼生物科技（北京）有限公司Yourownlabroratory——您的专属实验室NetOGlycpredictionserver，YinOYangserver，METAIIPredictProteinserver，O-GLYCBASE，GlycoModtool蛋白质结构数据库MMDB：的蛋白质结构数据库，要使用Cn3Dv4.1软件观看PDB：要使用SwissPDBviewer软件观看蛋白质综合数据库PIR：